Penulis / NIM
ZIKRAN ABDULLAH / 442417028
Program Studi
S1 - KIMIA
Pembimbing 1 / NIDN
Dr YUSZDA K SALIMI, S.Si, M.Si / 0023037106
Pembimbing 2 / NIDN
Prof. Dr NETTY INO ISCHAK, Dra., M.Kes / 0023026803
Abstrak
Senyawa 3-hydroxylup-20(29)-en merupakan senyawa golongan triterpenoid yang diketahui memiliki aktivitas antikanker. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mempelajari interaksi senyawa 3-hydroxylup-20(29)-en dengan Esterogen Receptor-����¯�¿�½������± (ER-����¯�¿�½������±) yang merupakan protein yang terkait dengan sel kanker payudara. Interaksi ligan dengan Esterogen Receptor-����¯�¿�½������± dipelajari dengan menerapkan metode Molecular Docking dan Molecular Dynamic. Hasil validasi situs ikatan dengan menerapkan protokol penambatan ulang (redocking) menunjukkan nilai Root Mean Square Deviation konformasi ligan standar N-[(1R)-3-(4-hydroxyphennyl)-1-methylpropyl]-2-[2-phenyl-6-(2-piperidin-1-ylethoxy)-1H-indol-3-yl]acetamide sebesar 0.998 ����¯�¿�½... dan nilai energi bebas ikatan yang terbentuk sebesar -11,8 kkal/mol. Hasil energi bebas ikatan ligan uji 3-hydroxylup-20(29)-en sebesar -9,7 kkal/mol. Hasil analisis Molecular Dynamic menggunakan MMGBSA dengan nilai energi bebas ikatan untuk ligan standar sebesar -49,5 kkal/mol dan ligan uji sebesar -27,1 kkal/mol. Interaksi residu aktif Esterogen Receptor-����¯�¿�½������± pada 3-hydroxylup-20(29)-en dengan kontribusi terbesar terdapat pada residu Leu 346, Met 388 dan Met 421 dengan energi ikatan sebesar -5 ����¯�¿�½������± 1 kkal/mol dan kontribusi terbesar ligan standar terdapat pada residu Glu 353 dengan nilai energi sebesar -10 ����¯�¿�½������± 10 kkal/mol, di susul dengan residu Thr 347, Ala 350 dan Leu 525 dengan energi sebesar -5 ����¯�¿�½������± 1 kkal/mol. Hasil Molecular Dynamic menunjukkan bahwa energi ikatan yang terbentuk lebih kecil dibandingkan dengan hasil Molecular Docking. Hal ini menunjukkan metode Molecular Dynamic mampu mengoptimalkan interaksi antara protein Esterogen Receptor-����¯�¿�½������± dengan 3-hydroxylup-20(29)-en dan memiliki potensi sebagai inhibitor terhadap sel kanker payudara ER+.
Download berkas
